Nachwuchsgruppe 'Glykan-Protein Interaktionen'

Glykane sind eine wichtige Kohlenstoffquelle für marine Bakterien. Mit unserer Forschung wollen wir verstehen, wie diese Mikroben Glykane aus der umgebenden Wassersäule aufnehmen. Dafür untersuchen wir glykanbindende Proteine auf der Zelloberfläche der Bakterien.

Links: Teamwork - CBMs gekoppelt an katalytische Module (CAZymes). Rechts: Glykan-Fänger: reines CBM-Protein.

Diese Proteine sind häufig multimodular aufgebaut und setzen sich aus Kohlenhydrat-bindende Modulen (Carbohydrate-Binding Modules, CBMs) zusammen. CBMs katalysieren im Gegensatz zu kohlenhydrataktiven Enzymen (Carbohydrate-Active Enzymes, CAZymes) keine chemischen Reaktionen. Stattdessen binden CBMs selektiv Glykane aus komplexen Gemischen und steigern dadurch die Effizienz des Glykanabbaus durch CAZymes.

Wir erforschen, wie CBMs ihre Glykan-Liganden erkennen und welche Faktoren ihre Bindungsspezifität bestimmen. Langfristig soll unsere Arbeit aufklären, wie CBMs zum marinen Kohlenstoffkreislauf beitragen.

Zur Untersuchung von Proteinen, die an der Erkennung und Nutzung von Glykanen beteiligt sind, kombinieren wir Methoden der Proteomik, Biochemie und Strukturbiologie. Durch die Analyse von Proteinexpression, der zellulären Lokalisation, Ligandenbindung und dreidimensionaler Proteinstruktur entschlüsseln wir die molekularen Mechanismen, die die Funktion dieser Proteine bestimmen.

Wir sind Teil des Sonderforschungsbereichs/Transregio (SFB-TRR) CONCENTRATE und arbeiten im Projekt B2 TRAP.

 

Team

Dr. Marie-Katherin Zühlke

Nachwuchsgruppenleiterin

Center for Functional Genomics of Microbes
17489 GreifswaldFelix-Hausdorff-Straße 8
17489 Greifswald

Telefon +49 3834 420 5949
Telefax +49 3834 420 4238
marie-katherin.zuehlkeuni-greifswaldde

seit 2025 Abeitsgruppenleiterin, Universität Greifswald, Institut für Pharmazie, Glykan-Protein Interaktionen
seit 2023 Wissenschaftskommunikatorin, Kunst&Wissenschaft Projekte
seit 2019 Gastforscherin, Station Biologique de Roscoff, Jährliche Forschungsaufenthalten gefördert durch die DFG, Erasmus, French Embassy (PROCOPE Mobility)
seit 2017 Wissenschaftliche Mitarbeiterin, Universität Greifswald, Institut für Pharmazie, Glykanabbau durch marine Bakterien
2013-2017 Doktorarbeit, Universität Greifswald, Institute für Mikrobiologie, Biotransformation von Umweltschadstoffen durch Bakterien
2008-2013 Biologiestudium, Diplom, Universität Greifswald
  • Umweltmikrobiologie/Marine Mikrobiologie, Biochemie, Strukturbiologie
  • Funktionelle Charakterisierung multimodularer Glykanbindender Proteine
  • Proteomics glykanabbauender Bakterien

Franziska Brühl

Doktorandin

Telefon +49 3834 420 4911
 franziska.bruehluni-greifswaldde

Pia Kunde

Master-Studentin

 

Wissenschaftskommunikation

Kunst&Wissenschaft

Collab - Marie-Katherin Zühlke, Astrid Brünner, Susanne Gabler

Wie kann Kunst die Vermittlung wissenschaftlicher Sachverhalte unterstützen? Durch die interdisziplinäre Zusammenarbeit von Wissenschaft und Kunst erforschen wir neue Wege, wissenschaftliche Forschung für unterschiedliche Zielgruppen zugänglich zu machen. Aus unserer Arbeit sind bereits zwei Ausstellungen hervorgegangen, die wissenschaftliche Inhalte durch künstlerische Praxis erfahrbar machten. 

In unserer Arbeit verwenden wir verschiedene Medien und Formate, darunter (Tanz-) Performances, Installationen, Malerei und Augmented Reality. Darüber hinaus haben wir eine Lecture Performance zum Algenpolysaccharid Alginat entwickelt. In diesem Format wird ein wissenschaftlicher Vortrag durch performative Elemente ergänzt, um alternative Zugänge zu komplexen wissenschaftlichen Themen zu eröffnen und neue Formen der Auseinandersetzung mit ihnen zu ermöglichen.

Ausstellungen:

2025 METABOLAT Koeppenhaus Greifswald

2026 NEWSPECTIVES Alfried Krupp Wissenschaftskolleg Greifswald